2029年，nerv打败seele阻止了人类补完计划十四后，和平的日子再次打破。
第三新东京新nerv总部的指挥大厅里，指挥台上一名蓝发女子正冷冷看着大屏幕上的画面，一只墨绿色的巨大怪物，长着狼一样的脑袋，修长的手臂和不成比例的短腿。空中的战机和地上的坦克正拼命的向其倾泻着火力。
“的确是十九使徒，时隔十四年终于要再度开始了。”
“是的，一切从现在开始。”坐在一旁的橙发女子淡定的说到。
蓝发女子脸上露出一丝冷笑：“不过剧本看起来真是令人眼熟啊。”
“该死！竟然毫发无损！”一名nerv常规部队军官愤怒的吼到。
“我们的部队遭受了很大损失！再这样下去就撑不住了！”另一名军官慌乱的报告。
“用N2炸弹。”指挥台上传来了一声低沉的命令声。
随着一声巨响，屏幕上只剩一片雪花。一分钟后画面恢复，怪物满身伤痕的站在爆炸留下的坑里，但很显然那都是些皮外伤，并且伤处在慢慢开始复原。
指挥室里传来一阵惊叹的声音。
蓝发女子看着屏幕冷冷的说到：“N2炸弹并不能对使徒造成伤害你应该清楚。”
“当然，只不过是拖延一下时间而已，马上我们的王牌就要到了。”
第三新东京国际机场的外的公交车站旁，碇原惠听着手机里的忙音，愤怒的吼到：“什么破玩意儿！号称世界最强的亚洲区域通讯说失灵就失灵了？难道是刚才爆炸的缘故吗？”说着关上拨号界面打开电子邮箱找出一封邮件并打开：
碇原惠小姐，我是负责接你的玲原东治。请你在下飞机后呆在机场外的公交站等待，不要乱走动。我将准时前去那里接你。____2029年6月21日20：15
“哼！这个样子给女生发邮件的，一看就是个闷头闷脑的古板男！”又看了眼邮件里的照片，完全就是一张证件照。“看起来确实是个闷家伙！而且说好的准时来接居然迟到了！第一次有男的让本小姐等这么久！真是可恶！”说着拍打着头上的灰尘，橙色的长发再次焕发光泽。“破避难所有点震动就掉这么多土，一定是豆腐渣工程！”
就在碇原惠还在抱怨的时候，一辆黑色切诺基停在了她的面前，驾车的男子迅速打开车门
“不好意思我来晚了，碇原惠小姐。我是专程来接你的。”东治一脸歉意的说到。
“什么吗！害本小姐等那么久！”
“不好意思，刚才紧急情况，道路都禁止通行了。”
“所以你就把我一个人扔在这里自己去避难了？”碇原惠没好气的说到，“亏你还是个成年人！”
“好了好了，有什么待会儿再抱怨，我们得赶快走了。”
玲原东治好不容易把眼前这位大小姐哄上车，踩下油门时突然感到腿上一阵酸痛，虽然移植的腿已经跟了自己五年了，但还是不时的要折磨一下自己。
“怎么那副表情啊，第一次见面令你很不愉快吗？”
“额……没什么，只是想到点事情……”东治随便找了个借口。黑色切诺基向着新nerv总部方向飞奔而去。
转过一段山坡路，碇原惠被眼前看到的东西惊呆了。一个她从来没有见过的巨大怪物站在远处的大坑里，周围一片焦土，数架直升机正围着一动不动的怪物盘旋监视着它。
“这就是刚才爆炸的原因吗？”
“是的。”
“那这家伙已经死了吗？”
“没有。”
“那么……”
“待会儿到了你就都知道了。”玲原打断了她的提问。
“真是无趣的家伙……”
“你跟你母亲还真是像啊。”
“女儿长的像母亲很正常嘛。”
“我是说性格上。”
“你认识我母亲？”
“当然了，就是她让我来接你的。哦对了，自我介绍一下，我叫玲原东治，nerv作战科科长，你母亲的同事和老同学。”
“额……我叫碇原惠，哦你说你是我母亲的老同学，那你也是我父亲的老同学吧？”
“当然，我和真嗣可是铁哥们儿。”
“唉，可惜我连他的面都没见过，甚至照片都没见过……”原惠脸上透出了一丝不易察觉的忧伤。
再次提起“真嗣”这个名字，玲原不禁回想起了往事，十四前，nerv和seele的决战。在seele的量产机全部被化为灰烬后，如恶魔一般的初号机在六对光之翼消失后坠落在地面，回收班在打开插入栓时里面却只有lcl，他消失了。只留下丢了魂一样的明日香和她肚子里的孩子。
“玲原先生你能好好开车吗？”
原惠的话打断了玲原的回忆，此时他才发现自己已经把车开到了对向车道上。
慌忙把车打回到原车道上，玲原告诉自己现在不是回忆往事的时候。
“你知道你母亲叫你来干什么吗？”
“不知道。”
“那你知道你母亲的工作吗？”
“我问过学院的老师，他们只会用那种拍马屁的语气跟我说‘你的父母是拯救世界的英雄，打败邪恶seele的勇士，阻止人类补完计划的救世主’这类奉承话。”
“那是过去。”玲原回答。
原惠不耐烦的说到：“我已经两年没见过我妈了，谁知道她现在在干什么，或者说我从来不知道她在干什么。”
“等到地方你就知道了。”
不久两人到了nerv总部的地下都市。
“比柏林的还大。”原惠感到一丝惊叹。
“那是，柏林的地下都市也是照着这里建的。”玲原带着一丝骄傲的回答。
穿过不晓得多少条通道后，玲原东治带着碇原惠来到一间办公室门口。
“剑介你在吗？”玲原一边敲门一边叫到。
“喂！吵什么！你不知道装备科的研究室是禁止喧哗的吗？”门打来，相田剑介很不高兴的从里边走出来“我说玲原，你能改改你的大嗓门吗？”
“啊哈～那啥～人我带来了，赶紧带她去见明日香吧。”东治赶紧转移话题。
“你好，我叫相田剑介。”剑介并没有继续搭理东治。
“你好，我叫碇原惠。”
嗯，还真是一看就能认出是那俩人的孩子。相田剑介看着眼前这个女孩心里想到。
“剑介，我们还有正事儿。”
“嗯，跟我来吧。”说着相田带着俩人向第六通道走去。
漫长的自动扶梯带着三人来到一扇巨大的铁门前，守卫跑上前向着相田和玲原敬礼。
“您好，相田博士，玲原科长。”
“嗯，你好。”
大门缓缓打开，三人进入这间大的可怕的“仓库”。随后大门又缓缓关上。
“喂，我们来这里干什么？”碇原惠疑惑的问。突然灯光亮了起来，眼前的景象吓了她一跳，巨大的水池里，一个紫色巨人露出头部，似乎正在看着她一样。
“这里怎么会有这么巨大的机器人？”碇原惠惊讶的问。
一旁的相田推了推他的黑框眼镜然“这不是机器人，这是Eva初号机，人类为对抗使徒而制造的终极决战兵器，也是你父亲曾经驾驶过的。”
“嗯……小时候好像听妈妈说过一点点……但是……”碇原惠已经不知道该说什么了。
“你来了。”一个熟悉的声音传来。
“妈妈……”碇原惠抬头看向声音传来的地方，高处的控制台上，一个她许久未见的熟悉面孔正看着她。这个和自己有着同样橙发和蓝瞳的女人正是他的母亲明日香。
“妈妈……”碇原惠再次叫出那两个字，似乎有什么话想说但又说不出口，母女两人只是默默的对视着。
“使徒自我修复完成，再度开始行动！”广播里传来了刺耳的警报声。
“既然已经来了，就没必要愣着了，马上出击。”明日香的命令打破了母女两人间的沉默。
玲原和相田似乎并不感到惊讶。
“什么？你的意思是让我驾驶这个东西去……搞什么啊！你把我一个人丢在柏林那么久，现在又突然叫我来就为了这个？”碇原惠愤怒的冲明日香吼到。
“没错。”明日香很确定的说。
“喂！这种事你至少提前告诉我啊！至少让我提前准备一下至少训练一下啊！”
“有必要自然会告诉你。”明日香冷冷的说。
“哼！有用时才想起我了？你当我是什么？”
“你干不干？不干可以回柏林了。”明日香话语里带着一丝不耐烦。
“没关系，你父亲当年第一次作战也没训练过，没问题的。”“对对，没问题的。”相田和玲原在一旁劝说着。
“不干！不需要时把我扔在家，现在有用处了又叫我来，你当我是什么？不干！哼！”碇原惠愤怒的朝明日香怒吼。
明日香看了一眼碇原惠然后向着身后显示屏上的绫波说：“丽，第七适格者没用了，通知医疗科把林恩带来。技术部把初号机的程序换成林恩的。”
“可是林恩的伤还没好呢。”
“没关系，不是致命伤。”
几个穿白大褂的推着一个看起来十几岁的男孩进来。
刚才还在生气的原惠好奇的盯着眼前这个男孩，灰白色头发赤色的眼瞳，五官看起来跟自己颇有相似之处，从身上的绷带看来伤的不轻，而旁边的玲原和相田看着男孩都露出奇怪的表情。
此时明日香的声音再次响起：“林恩，第七适格者没用了，现在你去驾驶初号机。”
男孩艰难的从床上爬起来，但使徒攻击带来的震动让他很快倒下。一旁的玲原赶紧把他拉起来。然后看着明日香说：“还是再给原惠一次机会吧，你看林恩这个样子也实在……”
“nerv不需要废物。”明日香冷冷的打断了玲原。
“你说谁是废物！？你难道认为我连一个重伤员都不如吗？！”碇原惠再次怒吼。
“是不是废物要自己证明。”明日香用一种轻蔑的语气回答。
“我来驾驶！我这就证明给你看！我不是废物！”碇原惠愤怒而又坚定的回答。
绫波丽看着眼前这跟14年前雷同的一幕顿时觉得又好气又好笑。看着回到指挥中心指挥台的明日香没好气的问：“这剧本也太让人熟悉了吧？”
“或许吧，大概是巧合。”明日香很平静的回答。
“巧合？我看是某人的恶趣味吧？”绫波的话依然没好气。
“当年床上躺的是你。”明日香边看着屏幕上已经进入插入栓的碇原惠边说。
“话说回来，母子关系搞的这么僵以后可难办啊。”
“我自己的女儿我了解，不刺激她一下她别指望她能按命令行事。不过我可不是碇源堂那个老变态，我女儿终究是我女儿。”看着屏幕上正在发射的初号机，明日香脸上露出一丝自信的微笑。
“但你现在正在照抄那个人的剧本难道不是吗？”
“只是借鉴一下开头而已，我对他的剧本不感兴趣，我们有自己的剧本，也有我们自己的目的。”
